闇との決戦から二年ブルードラゴンを失ったシュウは、ブーケ、レゴラスと共にレジスタンスを組織し、ロギ率いるローゼンクロイツといまなお戦っていた。 そんなある日、突如空から謎の物体が降って来る。シュウとブ