在东京街头，一切成谜的吃人怪人“喰种”正悄悄在人类世界扩张势力平凡大学生金木研（洼田正孝 饰）倾慕咖啡店女孩神代利世（苍井优 饰），约会后遭到喰种猎食而性命垂危，手术时被移植喰种的器官，变成半人半喰种

就读国中的女孩有栖川彻子（苍井优 配音），因父母离婚而转学来到了石之森学园令她有些气闷的是，同学们皆以诡异的目光看她，甚至对她敬而远之。从同班同学睦美口中得知，彻子现在所坐的桌子，其前主人曾经陷入一起